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国际首个、顶级期刊!海大包振民院士团队发布软体动物综合基因组数据库

2020-10-30 15:17 青岛日报社/观海新闻  

青岛日报社/观海新闻10月30日讯 日前,中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室包振民院士团队取得重要成果,在国际数据库领域顶级期刊《核酸研究》在线发表了国际首个软体动物综合基因组数据库。

随着基因组学数据以史无前例的规模增长,深度挖掘复杂高维度的海量组学资源已成为当前生命科学领域面临的巨大挑战。构建系统便捷、功能全面的基因组学数据库在解决这一难题上发挥着重要作用。当前,国际上广泛使用的大型公共基因组数据库仍主要聚焦并服务于人类医学及小鼠、斑马鱼、果蝇等模式生物研究。对非模式生物类群(如大部分海洋生物)而言,至今缺乏适当的整合平台及深度分析工具,以满足日益增长的对复杂海量组学数据的分析需求。

软体动物起源于5亿年前早寒武纪,是进化上最成功的无脊椎动物群体之一。软体动物现存种类高达10万种以上,是动物界中仅次于节肢动物的第二大门类,对软体动物类群的起源演化研究是学术界长期以来关注的热点。此外许多软体动物也是重要水产经济物种,占世界水产总产量高达22%。近些年软体动物基因组学发展迅速,取得的重要科学发现层出不穷,极大地提升了目前对动物起源和适应性演化的认知深度。当前,软体动物组学资源通常以原始数据状态存储在NCBI等资源存储型为主的公共数据库中,缺乏可实现数据资源整合和深度分析的综合平台,更缺乏针对软体动物生物学特性所设计的定制分析工具。本研究团队通过广泛收集软体动物基因组学资源,系统梳理整合多组学数据及开发丰富的分析工具,构建了迄今物种覆盖度最广、组学资源最丰富、功能最全面的软体动物基因组学分析平台MolluscDB。(青岛日报/观海新闻记者 郭菁荔)

责任编辑:岳文燕

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